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芽孢桿菌KJ82的全基因組測序及分析

基因組學與應用生物學 頁數(shù): 12 2022-04-25
摘要: 以克百威為代表的氨基甲酸酯類農(nóng)藥在土壤中殘留的問題隨著其廣泛使用受到越來越多的關(guān)注。前期從阿克蘇10年以上連作棉田鹽堿土壤富集的克百威降解菌群中分離到一株細菌KJ82,現(xiàn)利用PacBio SequelⅡ三代測序平臺獲得了該菌株的全基因組序列,使用Microbial assembly、HGAP4、Canu、Glimmer等軟件對該菌株進行基因組組裝、編碼基因的預測、功能注釋、參考...

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