基于改進TF-IDF算法的基因通路富集方法
中國醫(yī)學物理學雜志
頁數: 9 2022-09-25
摘要: 提出一種綜合考慮通路局部和全局信息的基因通路富集分析(GIGSEA)方法。首先利用基因相互作用數據,通過基因在通路的局部重要性和在通路數據庫的全局特異性計算基因的影響力;然后將基因影響力和表型相關性值融合在一起,計算通路的富集分數;最后通過置換基因富集出統(tǒng)計學顯著的通路。將GIGSEA方法運用于肝細胞癌和結腸直腸癌數據集進行風險通路富集,與基因集富集分析方法相比,GIGSEA方...