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菌群16S rRNA基因測序的聚類分析方法研究進(jìn)展

中國微生態(tài)學(xué)雜志 頁數(shù)： 6 2023-07-15
摘要： 16S核糖體RNA(16S rRNA)基因測序是微生物分析的重要手段。16S rRNA基因測序的原始數(shù)據(jù)復(fù)雜，存在許多誤差，分析前一般需要先進(jìn)行序列質(zhì)量控制，即對數(shù)據(jù)進(jìn)行去噪、去冗余和去嵌合，最終將質(zhì)量控制后的數(shù)據(jù)分為可操作分類單元（OTU）或ASV，在OTU或ASV基礎(chǔ)上再進(jìn)行菌群的各種分析。經(jīng)過多年改進(jìn)，聚類方法逐漸以UPARSE、DADA2、Deblur和UNOISE3等...

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