癌癥標(biāo)志本體構(gòu)建與應(yīng)用

摘要： 目的 構(gòu)建一種可溯源的癌癥標(biāo)志知識(shí)本體，支持基因突變、癌癥標(biāo)志和細(xì)胞系等相關(guān)數(shù)據(jù)整合、標(biāo)準(zhǔn)化和關(guān)聯(lián)，并基于該本體實(shí)現(xiàn)新知識(shí)發(fā)現(xiàn)。方法 基于“七步法”和現(xiàn)階段本體的構(gòu)建方法，明確癌癥標(biāo)志本體覆蓋范圍、框架結(jié)構(gòu)、可復(fù)用的術(shù)語和新增術(shù)語；以結(jié)直腸癌為例，利用文本挖掘和文本分類技術(shù)對(duì)PubMed文獻(xiàn)中結(jié)直腸癌標(biāo)志相關(guān)知識(shí)進(jìn)行提取，利用癌癥標(biāo)志本體對(duì)提取的知識(shí)進(jìn)行規(guī)范化表達(dá)。結(jié)合癌癥體細(xì)...