通過圖注意力網(wǎng)絡識別空間轉(zhuǎn)錄組中的空間域

摘要： 由于數(shù)據(jù)的高維和復雜性，空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析一直是一個具有挑戰(zhàn)性的問題，而聚類分析則是空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的核心問題。本文提出了一種基于圖注意力網(wǎng)絡的深度學習方法，用于空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的聚類分析。首先，對空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行增強，然后使用圖注意力網(wǎng)絡對節(jié)點進行特征提取，最后使用萊頓（Leiden）算法進行聚類分析。通過聚類的評價指標發(fā)現(xiàn)，與傳統(tǒng)的非空間及空間聚類方法相比，本文提出的方...