基于全基因組測(cè)序分析1起產(chǎn)氣莢膜梭菌導(dǎo)致的腹瀉暴發(fā)事件

摘要： 目的 對(duì)1起產(chǎn)氣莢膜梭菌導(dǎo)致腹瀉暴發(fā)事件進(jìn)行病原學(xué)分析。方法 采集病例肛拭子樣本和環(huán)境涂抹樣本，肛拭子樣本增菌前后分別進(jìn)行產(chǎn)氣莢膜梭菌plc和cpe基因熒光PCR檢測(cè)和產(chǎn)氣莢膜梭菌分離培養(yǎng)，對(duì)分離菌落進(jìn)行全自動(dòng)生化鑒定和飛行時(shí)間質(zhì)譜鑒定。對(duì)鑒定為產(chǎn)氣莢膜梭菌的分離株進(jìn)行全基因組測(cè)序，分析菌株攜帶毒力基因和耐藥基因情況，基于全部分離株核心基因組單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行遺傳聚集性分析。結(jié)... （共6頁(yè)）