表達譜芯片對EB病毒誘導甲基化沉默基因的篩選

摘要： 目的篩選EB病毒(EBV)相關胃癌中大量EBV誘導的甲基化沉默基因,為EBV相關腫瘤的研究提供理論依據(jù)。方法采用Agilent人類全基因組表達譜(4×44K)芯片,檢測去甲基化藥物Aza作用前后的EBV陽性和陰性胃癌細胞株,篩選出EBV相關胃癌特有的甲基化沉默基因。應用實時熒光定量PCR和亞硫酸鹽測序(BGS)方法對結果進行驗證。結果去甲基化藥物作用前后的EBV陽性細胞系差異基因與EBV陽性與陰性胃癌細胞系差異基因的共同基因共68條,此為EBV相關胃癌甲基化沉默特異性基因。在差異倍數(shù)為1.5和2.0時,分別檢測到19和3條基因。實時熒光定量PCR和BGS驗證結果顯示,篩選基因在EBV陽性胃癌細胞系中處于低表達、高甲基化狀態(tài)。結論篩選和鑒定EBV陽性細胞株甲基化沉默的抑癌基因,對明確EBV相關腫瘤的發(fā)病機制具有重要作用。 （共5頁）