基于RNA-Seq技術的“紫娟”茶樹轉錄組分析

摘要： 本研究基于RNA-seq技術對"紫娟"茶樹芽、第二葉、開面葉、成熟葉四個時期的轉錄組進行測序以及生物信息學相關分析。研究結果表明,經組裝分析獲得268 172條transcript,進一步處理transcript獲得206 210條Unigene,將獲得的Unigene與Nr、SWISS-PROT、Tr EMBL、Cdd、pfam和KOG庫進行blast,有19 379個Unigene被注釋上25種KOG分類,注釋到KEGG的Unigene個數(shù)為13 608,涉及的pathway有302個。SSR查找發(fā)現(xiàn),從268 172個transcript中找到35 509個SSR位點。研究結果可為研究"紫娟"茶樹葉片在不同生長期的差異基因表達和開發(fā)紫色基因的分子標記奠定基礎。 （共6頁）