基于熒光標(biāo)記的紫娟茶樹轉(zhuǎn)錄組EST-SSR標(biāo)記開發(fā)
江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)
頁數(shù): 7 2018-09-05 12:08
摘要: 為開發(fā)紫娟茶樹轉(zhuǎn)錄組EST-SSR標(biāo)記,基于前期對(duì)紫娟茶樹芽、第2葉、開面葉、成熟葉轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序所得到的242 757條Unigene進(jìn)行多態(tài)性分析與評(píng)價(jià),再利用熒光標(biāo)記PCR技術(shù),規(guī)?;_發(fā)茶樹EST-SSR標(biāo)記。結(jié)果表明:從紫娟茶樹轉(zhuǎn)錄組中搜索得到46 041條Unigene含有57 976個(gè)SSR位點(diǎn),出現(xiàn)頻率為23.88%。EST-SSR類型以一核苷酸、二核苷酸、三核苷酸重復(fù)為主,占總SSR的98.54%。設(shè)計(jì)合成138對(duì)熒光SSR引物,采用熒光標(biāo)記PCR技術(shù)對(duì)4個(gè)差異較大的茶樹品種進(jìn)行引物篩選,其中44對(duì)引物得到高質(zhì)量的EST-SSR標(biāo)記位點(diǎn)。這些EST-SSR可用于茶樹遺傳多樣性分析、分子育種等。 (共7頁)