基于高通量測(cè)序的“紫娟”茶樹葉片miRNA分析
基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)
頁數(shù): 9 2017-05-28 08:32
摘要: "紫娟"是特異的茶樹資源,含有豐富的次生代謝物兒茶素、花青素、黃酮等,其生物合成是由多條代謝途徑通過相應(yīng)的節(jié)點(diǎn)連在一起的網(wǎng)絡(luò)途徑,受到多種結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控基因的控制。Micro RNA又稱miRNA,是一種非編碼RNAs,能通過對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控來調(diào)節(jié)植物生長、發(fā)育以及次生代謝等許多方面。本研究利用高通量測(cè)序技術(shù)分別構(gòu)建了"紫娟"茶樹芽、第二葉、開面葉、成熟葉的miRNA文庫并進(jìn)行測(cè)序,鑒定出已知的miRNA 126個(gè),分為26個(gè)家族,預(yù)測(cè)到的新miRNA 119個(gè)?;?紫娟"茶樹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析已知miRNA和新miRNA分的靶基因,分別預(yù)測(cè)到靶基因724條和2 285條。預(yù)測(cè)的靶基因大多為轉(zhuǎn)錄因子,包括調(diào)控次生代謝物花青素、黃酮類生物合成的MYB、b HLH轉(zhuǎn)錄因子等。這些注釋信息的完成為后期研究miRNA在調(diào)控茶樹葉片發(fā)育和次生代謝物的生物合成提供理論依據(jù)。 (共9頁)