棕紅懸鉤子葉綠體的基因組結(jié)構(gòu)與序列特征分析
西南林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué))
頁數(shù): 13 2023-12-12
摘要: 對(duì)棕紅懸鉤子葉綠體基因組測(cè)序后進(jìn)行中性繪圖、ENC-plot、PR2-plot和SSR位點(diǎn)分析,比對(duì)并構(gòu)建17個(gè)懸鉤子屬植物和2個(gè)大葉路邊青屬植物系統(tǒng)發(fā)育樹。以棕紅懸鉤子葉綠體基因組為參考,分析17種植物間的核苷酸多態(tài)性值,篩選高變區(qū)位點(diǎn),比較棕紅懸鉤子與另外9個(gè)物種的IR邊界區(qū)的收縮和擴(kuò)張情況。結(jié)果表明:棕紅懸鉤子葉綠體基因組全長(zhǎng)156 266 bp,其中大單拷貝區(qū)85 84...